Zaštita patlidžana od bolesti
Uz pravilan plodored, dezinfekciju tla u zaštićenim prostorima te sadnju zdravih presadnica patlidžana i preventivnu zaštitu, gljivične bolesti ne bi trebale predstavljati osobiti problem.


Ipak nasad može biti napadnut bolestima kao što su: gangrena korijenovog vrata, plamenjača (lat. Phytophthora capsici), bijela trulež (lat. Sclerotinia slerotionum), koncentrična pjegavost (lat. Alternaria spp.), pepelnica (lat. Leveillula taurica), venuće (lat. Verticillium dahliae) te gljive: (lat.Rhisoctonia solani, lat. Sclerotinia spp., lat. Phytium spp., lat. Phytophthora capsici, lat. Fusarium spp.)
Ove bolesti iste su kao i oni kod paprike pa se u slučaju pojave koje od ovih bolesti pristupa zaštiti po principu zaštite kod paprike.
Tretiranje sjemena (tiram) i sterilizacija tla obavezna su mjere borbe protiv parazita u tlu. Odmah nakon sadnje presadnica svaka biljka se zalijeva s 200-400 ml 0,25%-tnom otopinom Previcura. Taj postupak trebao bi se ponoviti svakih 15-20 dana.
Važno je provoditi preventivne mjere kao što su:
- plodored,
- obrada tla oranjem čime se gljiva unosi dublje u tlo gdje ne postoje uvjeti za razvoj plodnih tijela,
- zaražene biljke treba ukloniti iz nasad i spaliti prije nego što se razvije sklerocij (oblik u kojem gljiva prezimljuje),
- sterilizacija tla (termička ili kemijska)


Zaštita patlidžana od korova
Redovitom međurednom kultivacijom bilo mehaniziranom ili ručnom (zavisno o veličini proizvodne površine) istodobno uz prozračivanje tla uništavaju se i korovi.
Na taj način ne zahvaćaju se korovi unutar redova pa se u borbi protiv korova pristupa i primjeni herbicida.