Primjena herbicida neizbježna je pri uzgoju peršina na većim površinama jer korovi počinju nicati prije mrkve a brži im je porast pa onemogućavaju nicanje mrkve ili pak mogu „ugušit“ mladi nasad.
Izbor herbicida te vrijeme njihove primjene ovisi o sastavu korova (širokolisni ili uskolisni, jednogodišnji ili višegodišnji), veličini korova te tipu tla i načinu uzgoja peršina.
| Kultura | l/ha ili kg/ha | Vrijeme primjene | Spektar djelovanja |
| mrkva peršin celer pastrnjak komorač kopar | 2 – 4 l 1) ili 4 – 8 l 2) | nakon sjetve a prije nicanja kulture | suzbija sve iznikle korove |
| mrkva pastrnjak | 3 – 4 | nakon sjetve prije nicanja | jednogodišnji uskolisni i neki širokolismi korovi |
| mrkva pastrnjak | 0,25 – 0,5 | nakon sjetve prije nicanja | jednogodišnji širokolisni korovi |
| mrkva peršin* | 1 – 2,5 (4) | nakon nicanja korova | jednogod. (niža doza) i višegod. (viša doza) uskolisni |
Korovi se uništavaju i mehanički, međurednom kultivacijom.
